Em 1º de fevereiro de 2005, a Faculdade São Francisco de Assis foi inaugurada no prédio da Escola Billy Gancho em Nova Xavantina. São oferecidos cursos noturnos de Pedagogia, Administração e Ciências Contábeis, para integrar a preparação específica dos professores da Escola e de outros jovens da Região. Por razões burocráticas e por insuficientes recursos econômicos e de pessoal, a faculdade fechou em 2014.